http://images.gisher.ru/image-DC1F_520A223E.jpg и апи воркало по началу как всю работу проделал не воркает что делать?
По картинке, можно судить, что вы удалили некоторые файлы(или не только некоторые). Переустановите систему. И правильно ./chmod.sh
Символическую ссылку он не делает , потому что она есть. И зачем Вы её вообще пытаетесь сделать? У Вас phpmyadmin не доступен? Апач не запускается, потому-что синтаксическая ошибка на линии 260 в конфигурационном файле.